核工程设计研究所（简称设计所）于2021年在原堆工部设计所的基础上整合设立，是中国原子能科学研究院承担核工程设计任务的主体责任单位，是院“研发、设计、产业”一体化科技创新体系的关键环节。单位位于长阳科技协同创新中心，从业人员600余人，拥有政府特殊津贴获得者、中核集团首席专家、中核集团科技带头人等一大批高端人才。

设计所主要业务方向涵盖反应堆工程设计、先进核燃料循环系统燃料制造、后处理等环节的工艺设计和设备设计及相应技术服务。目前重点研发领域包括钠冷快堆、特种动力堆、铅基堆、低温供热堆等新型反应堆，承担了上级部委及中核集团等多个渠道的研发项目，完成了多种先进核能型号的研发及工程设计任务，具有丰富的核工程设计、研发及技术服务经验，形成了先进核能主导产品研制能力和创新开发能力。

在建设社会主义现代化强国、高效发展核能、加强科技创新的新时期，设计所将始终以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，不忘初心、牢记使命，坚决弘扬“强核报国、创新奉献”的新时代核工业精神和 “以身许国、敢为人先、严谨求实”的院训，围绕“十四五”发展目标，加快推进核能“三步走”发展战略及重大任务落实，助力原子能院建设成为世界一流核科研院所。